Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TMCO5AQ8N6Q1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCO5AQ8N6Q1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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