Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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