Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC50Q8IVM0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms