Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms