Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms