Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms