Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms