Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms