Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms