Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms