Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF827Q17R98 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF827Q17R98 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF827Q17R98 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF827Q17R98 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF827Q17R98 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms