Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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