Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SYPL1Q16563 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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