Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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