Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms