Protein–RNA interactions for Protein: Q15369

ELOC, Elongin-C, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOCQ15369 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ELOCQ15369 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOCQ15369 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms