Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms