Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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