Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms