Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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