Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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HNF4GQ14541 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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HNF4GQ14541 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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HNF4GQ14541 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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HNF4GQ14541 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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HNF4GQ14541 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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HNF4GQ14541 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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