Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms