Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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CUL4AQ13619 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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