Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms