Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SCGB2A2Q13296 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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