Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A2Q13183 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms