Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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