Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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