Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms