Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms