Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBQ06643 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBQ06643 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms