Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms