Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms