Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms