Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms