Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms