Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKL1Q00532 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms