Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms