Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRX1P78414 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms