Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG2P63267 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTG2P63267 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms