Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA2P62736 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms