Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms