Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms