Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX16P57768 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms