Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms