Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBASH3AP57075 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms