Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AQP4P55087 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms