Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLTPP55058 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLTPP55058 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms