Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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