Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms